德国马克斯·普朗克多学科科学研究所A. Marieke Oudelaar等人发现,染色质域体外重组显示核小体定位在三维基因组组织中的作用。相关论文近日在线发表于《自然-遗传学》。
研究人员在体外重组了酿酒酵母的染色质,并通过基于微球核酸酶的染色体构象捕获和分子动力学模拟,确定了其亚核苷酸分辨率的三维组织。结果表明,体外有规则间隔和相位的核小体阵列形成的染色质域与体内的染色质域相似。这表明,在酵母中,基本域的形成既不需要环挤压,也不需要转录。
此外,研究人员还发现,重组域的边界与无核小体区域相对应,且绝缘强度与其宽度成比例。最后,研究人员发现域的压实取决于核小体连接体的长度,较长的连接体能形成更紧凑的结构。
这些研究结果表明,有规律的核小体定位对染色质域的形成非常重要,并为自下而上的三维基因组研究提供了原理性证明。