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支原体感染、甲流、新冠病毒感染这三种易产生叠加感染，还有呼吸道合胞病毒、腺病毒、副流感病毒之间，以及与其他病原体之间也容易发生叠加感染，其中两种病毒叠加感染及病毒和细菌、支原体、衣原体叠加感染的情况更为常见。
事实上，关于今年冬季可能存在的呼吸道感染，早在之前就已经被学界有所预料。此前的多项研究揭示，多种呼吸道病原体同传会使症状加重、传播时间延长。
与单一病毒感染相比，多重病毒感染患者症状更严重，发热时间更长，更容易导致下呼吸道感染，如肺炎、支气管炎等；多重病毒感染患者需要医院住院治疗的比例更高，患儿出现呼吸衰竭和需要ICU监护的风险更大；多重病毒感染患者出现呼吸道疾病持续感染的可能性更大，可延长病程，延缓患者临床症状的改善。
国家感染性疾病临床医学研究中心主任、深圳市第三人民医院院长卢洪洲提醒，腺病毒和肺炎链球菌等可以与支原体混合感染，且患儿年龄越小，混合感染的风险越大。如果合并支原体感染，患儿的症状将会加重，家长应提高警惕。
一项公开发表的研究也显示，在儿童群体中，流感-新冠合并感染的比例（3.2%）明显高于成人患者（0.3%），这表明儿童更容易遭受流感-新冠合并感染。更重要的是，在新冠感染的危重患者中，流感-新冠合并感染的比例为2.2%，高于单独感染新冠患者（0.6%），说明合并感染流感病毒可能会加重新冠感染的重症程度。