瑞士巴塞尔罗氏创新中心的J. Gray Camp和其他人员共同研究了人视网膜类器官发育的多模态时空表型。相关研究成果近日在线发表于《自然-生物技术》。
据介绍,由人类多能干细胞产生的类器官为研究发育和疾病提供了实验系统,但缺乏不同空间尺度和分子模式的定量测量。
研究人员生成了视网膜类器官时间过程和原发性成人视网膜组织的多重蛋白质图谱。研究人员开发了一个工具包来可视化祖细胞和神经元的位置、细胞外和亚细胞成分的空间排列以及每个类器官和原代组织中的全局模式。
此外,研究人员还生成了一个单细胞转录组和染色质可及性时间进程数据集,并推断了类器官发育的基因调控网络。研究人员将具有空间分割细胞核的基因组数据整合到多模式图谱中,以探索类器官模式和视网膜神经节细胞(RGC)空间邻域,突出了RGC死亡的相关途径,并表明视网膜类器官中的嵌合遗传扰动为细胞命运调控提供了见解。