乙型肝炎病毒深度突变筛选揭示顺式偏好逆转录机制

美国洛克菲勒大学William M. Schneider等研究人员发现，乙型肝炎病毒深度突变筛选揭示了顺式偏好逆转录机制。该研究近日在线发表于《细胞》。

研究人员将基于RNA的乙型肝炎病毒（HBV）细胞培养系统与深度突变筛选（DMS）相结合，以解除HBV基因组中顺式和反式作用序列要求的耦合。研究结果支持聚合酶翻译的泄露核糖体扫描模式，提供了单核苷酸分辨率的HBV聚合酶适配性图谱，并确定了与HBV聚合酶终止密码子相邻的、使核糖体停滞的保守突变。

进一步的实验表明，停滞的核糖体将新生聚合酶拴在其模板RNA上，确保顺式偏好RNA包装和HBV基因组的反转录。

据悉，HBV是一种小型双链DNA病毒，长期感染2.96亿人。其紧凑的基因组中有一半以上在两个重叠的阅读框中编码蛋白质，在演化过程中，多种选择压力可能作用于共享核苷酸。