全基因组序列分析有助深入了解脑瘫基因组结构

加拿大病童医院Stephen W. Scherer研究组发现，全面的全基因组序列分析有助于深入了解脑瘫（CP）的基因组结构。这一研究成果近日在线发表于《自然-遗传学》。

研究人员对327名CP儿童及其亲生父母进行了全基因组测序（WGS）。研究人员将327名儿童中的37名（11.3%）归类为致病/可能致病（P/LP）变异，将327名儿童中的58名（17.7%）归类为意义不确定的变异。多类P/LP变异包括单核苷酸变异（SNV）/indels（6.7%）、拷贝数变异（3.4%）和线粒体突变（1.5%）。COL4A1基因的P/LP SNV最多。

研究人员还分析了两个儿科对照队列（n=203个三人家庭和n=89个兄弟姐妹家庭），为新发突变率和遗传负荷分析提供了基线，后者显示了新发有害变异与神经系统相关基因之间的关联。富集分析发现了以前未曾描述过的疑似CP候选基因（SMOC1、KDM5B、BCL11A和CYP51A1）。多因素CP风险概况和P/LP变异的大量存在，共同支持了WGS在所有CP和相关表型的诊断工作中的应用。