北京中医医院呼吸科前身为建于1957年的呼吸组和肝病组，为国内最早建立的中医专科，感冒清热冲剂、清肺丸、止嗽化痰定喘丸、养阴益气合剂、金花清感颗粒、温阳化痰止咳贴等在北京地区享有盛誉。
经60余年的建设，呼吸科中西医结合综合医疗水平稳步提升，在弥漫性肺间质疾病、难治性肺部感染、难治性咳嗽、呼吸困难等疾病的诊治方面特色鲜明，疗效突出。呼吸科门诊开设了顽咳、肺间质病、支气管扩张、呼吸困难专病门诊，建立了现代呼吸康复室。
