RNA构象倾向性决定细胞活性

美国哥伦比亚大学Hashim M. Al-Hashimi等研究人员发现，RNA构象倾向性决定了细胞的活性。相关论文近日在线发表于《自然》。

研究人员改变并确定了HIV-1 TAR RNA形成与蛋白质结合的构象倾向性。这些倾向性定量预测了TAR与Tat蛋白的RNA结合区的结合亲和力，以及HIV-1 Tat在细胞中依赖的转导程度。这些结果确立了基于集合的构象倾向性在细胞活动中的作用，并揭示了一个由特别罕见和短命的RNA构象状态驱动细胞过程的例子。

据悉，细胞过程是生物大分子之间相互作用的产物，它们联合起来形成具有生物活性的复合体。这些相互作用是由分子间的接触介导的，如果这些接触被破坏，就会导致细胞生理学的改变。然而，分子间接触的形成几乎普遍需要改变相互作用的生物分子构象。因此，结合亲和力和细胞活性主要取决于接触强度和形成具有结合能力构象状态的固有倾向。人们必须知道构象不利在生物学中无处不在，以便对蛋白质和核酸相互作用的结合能量进行定量建模。然而，概念与技术上的限制阻碍了人们剖析和定量测量构象倾向性如何影响细胞活性的能力。