RNA聚合酶驱动核糖核酸切除DNA修复

美国纽约大学Evgeny Nudler团队发现，RNA聚合酶驱动大肠埃希氏菌（E. coli）中的核糖核酸切除DNA修复。相关论文近日发表于《细胞》。

研究人员提出了结构、生化和遗传方面的证据，证明核糖核苷酸切除修复（RER）与转录直接耦合。亲和力pull-down和质谱仪辅助的细胞内蛋白交联图谱显示，在E. coli中，大多数核糖核酸酶HII（RNaseHII）分子与RNA聚合酶（RNAP）能够相互作用。在延伸过程中与RNAP结合的RNaseHII的冷冻电镜结构，包括有和没有靶标核糖核苷单磷酸酯（rNMP）底物，显示了特定的蛋白质-蛋白质相互作用，并定义了参与和未参与状态下的转录偶联RER（TC-RER）复合物。RNAP-RNaseHII相互作用的减弱损害了体内的RER。

结构-功能数据支持一个模型，即RNaseHII在一个维度上扫描DNA以寻找rNMP，同时“骑”上RNAP。研究人员进一步证明，TC-RER占了修复事件的很大一部分，从而使RNAP成为检测最频繁复制错误的监视“工具”。

据介绍，RNaseHII是清除基因组DNA中误入的rNMP的主要酶。