原发性和转移性癌症的遗传免疫逃逸概况
荷兰乌得勒支大学医学中心的Edwin Cuppen和Francisco Martínez-Jiménez合作提出了原发性和转移性癌症的遗传免疫逃逸(GIE)概况。相关研究成果近日在线发表于《自然-遗传学》。
近年的研究已经表征了原发性肿瘤的免疫逃逸概况。然而,晚期转移瘤在GIE患病率和动力学方面是否存在差异仍不清楚。
研究人员对6319个经过统一处理的肿瘤样本6条免疫逃逸途径中的GIE流行率进行了泛癌特征分析。为解决种系和肿瘤中HLA-I基因座的复杂性,研究人员开发了一个开源的综合框架LILAC。1/4的肿瘤具有GIE改变,在癌症类型中具有较高的机械性和频率可变性。原发性和转移性肿瘤之间的GIE患病率通常是一致的。研究人员发现,肿瘤演化中选择了GIE改变,HLA-I杂合性的局灶性丧失往往会消除HLA等位基因,呈现出最大的新表位库。
最后,高突变负荷肿瘤显示出作为免疫逃逸机制的HLA-I杂合性的局灶性丧失趋势,而在高突变肿瘤中,其他免疫逃逸策略占主导地位。