泛癌分析确定源自可转座元件的肿瘤特异性抗原

美国圣路易斯华盛顿大学Ting Wang研究团队发现，泛癌分析确定源自可转座元件（TE）的肿瘤特异性抗原。相关成果3月27日发表于《自然-遗传学》。

TE内的隐蔽启动子在肿瘤中可被转录重新激活，产生新的TE-嵌合转录物，从而导致免疫原性抗原。

研究人员在33个TCGA肿瘤类型、30个GTEx成人组织和675个癌症细胞系中，对这些TE外显事件进行了全面筛选，并确定了1068个TE候选者，它们有可能产生共享的肿瘤特异性TE嵌合抗原（TS-TEA）。全细胞裂解物和HLA-pulldown质谱数据证实，TS-TEA呈现在癌细胞表面。此外，研究人员强调了由TE启动子转录的肿瘤特异性膜蛋白，它们构成了癌细胞外表面的异常表位。总的来说，研究人员展示了TS-TEA和非典型膜蛋白在泛癌中的高流行率，这些膜蛋白有可能被治疗性地利用和靶向。