科学家揭示一个类病毒环状RNA世界

美国国立卫生研究院的Eugene V. Koonin团队通过对元转录组的挖掘，揭示了一个巨大的类病毒环状RNA世界。相关论文1月24日在线发表于《细胞》。

研究人员开发了一种用于识别类病毒共价闭合环（ccc）RNA的计算方案，并将其应用于5131个元转录组和1344个植物转录组。该研究获得了11378个类病毒cccRNA，涵盖4409个物种水平的类病毒元件，与之前确定的类病毒元件相比增加了5倍。在这个多样化的集合中，研究人员发现了许多假定的类病毒、卫星RNA、逆转录酶和核酶样病毒。研究人员在cccRNA中鉴定出不同的核酶组合和独特的核酶。自切割核酶在ambiviruse、一些线粒体样病毒和衣壳编码卫星病毒样cccRNA中被鉴定出来。类病毒cccRNA在不同的转录组和生态系统中广泛存在，这意味着它们的宿主范围比目前已知的要广泛得多，并且与CRISPR间隔序列的匹配表明一些cccRNA在原核生物中复制。