新方法追踪细胞转录历史

美国哈佛大学的Adam E. Cohen研究组取得一项新突破。他们研究出可用于细胞内记录的时间标记磁带。该研究1月2日发表于《自然-生物技术》。

据了解，记录细胞的转录历史将有助于人们更深入了解细胞的发育轨迹和对外部扰动的反应。

研究人员研发出一种工程蛋白纤维，该纤维在生长过程中结合了不同的荧光标记，以存储类似于自动收报机样的历史记录。嵌入式HaloTag报告器结合了内源性染料，从而产生彩色条纹，将每根光纤的生长映射到相应时间。由感兴趣启动子驱动的eGFP标签共表达记录了转录激活的历史。固定样品上的高分辨率多光谱成像可读取细胞历史，并且相对于HaloTag时间戳的eGFP标记插值可提供准确的绝对计时。

研究人员展示了多西环素诱导HEK细胞转录和培养神经元中cFos启动子活化的记录，在12小时的记录中，单细胞绝对精度为30~40分钟。这种基于蛋白质的自动收报机标签设计可应用到不同生理模式的大规模并行单细胞记录中。