原位和体内成像引导空间分辨率单细胞测序

美国马萨诸塞州总医院Charles P. Lin和Christa Haase合作开发了Image-seq技术，通过原位和体内成像引导空间分辨上的单细胞测序。相关论文11月24日发表于《自然-方法学》。

研究人员开发了Image-seq技术，这是一种在图像引导下从特定空间位置分离的细胞上提供单细胞转录数据的技术，从而保存了目标细胞的空间信息。因此，该技术将空间信息与来自单个完整细胞高度敏感的RNA测序读数相结合。研究人员使用高通量、基于液滴测序以及SMARTseq-v4文库制备来展示其在骨髓和白血病生物学中的应用。研究人员发现，DPP4在急性髓系白血病早期进展过程中是一个高度上调的基因，它标志着一个更具增殖性的亚群，该亚群局限于特定的骨髓微环境。

此外，Image-seq技术分离完整存活细胞的能力使其与一系列下游单细胞分析工具兼容，包括多组学实验方案。