扩展全球RNA病毒库揭示不同噬菌体支系

Wed Oct 12 08:52:42 CST 2022

以色列特拉维夫大学Uri Gophna等研究人员合作发现,全球RNA病毒库的扩展揭示出不同的噬菌体支系。相关论文近日在线发表于《细胞》。

研究人员挖掘了5150个不同的元转录组,并发现了>250万个RNA病毒等位点。对>33万个依赖RNA的RNA聚合酶(RdRP)分析表明,这一扩展相当于已知RNA病毒多样性的5倍。

基因内容分析显示了以前在RNA病毒中没有发现的、与病毒—宿主相互作用有关的多个蛋白质结构域。扩展的RdRP系统发育支持五个已建立分类门的单系性,并揭示了两个假定的额外噬菌体门和许多假定的额外类和目。急剧扩张的Lenarviricota门,由细菌和相关的真核病毒组成,现在占RNA病毒群的1/3。CRISPR间隔和溶菌蛋白的鉴定表明,以前与真核生物有关的picobirnavirus和partitivirus的亚群可感染原核生物宿主。

据悉,高通量RNA测序为探索地球上的RNA病毒组提供了广泛的机会。

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