小儿急性淋巴细胞白血病的基因组图谱发布

美国圣犹大儿童研究医院Charles G. Mullighan团队近期取得重要进展，他们研究发布了小儿急性淋巴细胞白血病的基因组图谱。相关研究9月1日在线发表于《自然—遗传学》。

通过对2754名急性淋巴细胞白血病（ALL）儿童患者进行全基因组、外显子组和转录组测序，研究人员发现，尽管突变量普遍较低，但ALL病例中每个样本有4（中位数）个推定的体细胞驱动基因改变，有376个假定的驱动基因在所有ALL疾病亚型中存在不同的分布。大多数样本至少含有一种罕见的基因改变，包括与泛素化、苏木化、非编码转录物以及其他功能相关的70个假定癌症驱动基因。在超二倍体B-ALL中，染色体增加是在紫外诱导突变之前早期同步获得的。相比之下，在B-ALL病例中，紫外诱导的突变先于染色体增加，并伴有21号染色体内扩增。

研究人员还证明了亚型内遗传改变的预后意义。有趣的是，DUX4和KMT2A重排的亚型分为表达CEBPA/FLT3或NFATC4的亚组，具有潜在的临床意义。总之，这些结果加深了对ALL基因组图谱和相关预后的理解。