plexDIA提高灵敏蛋白质组学通量

近日，美国东北大学Nikolai Slavov等研究人员合作通过plexDIA提高灵敏蛋白质组学的通量。《自然—生物技术》近日在线发表了该成果。

为了提高敏感蛋白质组学的通量，研究人员开发了一个实验和计算框架，称为plexDIA，用于同时对肽和样品进行多路分析。使用plexDIA的复用分析可以在不降低蛋白质组覆盖率或定量准确性的情况下，以倍数增加标签数量的通量。通过使用三复合非异构质量标签，plexDIA可以对纳克级样品中多3倍的蛋白质比率进行定量。使用1小时的活性梯度，plexDIA在每个标记的三联体样本中量化了约8000个蛋白质，并提高了数据的完整性，将不同样本的缺失数据减少了2倍以上。

应用于单个人类细胞，plexDIA在每个细胞中量化了约1000个蛋白质，并在每个细胞使用约5分钟的活性色谱时，在一个plexDIA组中实现了98%的数据完整性。这些结果建立了一个通用框架，可用于提高敏感和定量蛋白质分析的通量。

据了解，目前的质谱方法能够对大量的样品进行高通量的蛋白质组学分析，但低样品量的蛋白质组学分析在深度和通量上仍然受到限制。