研究揭示结构变异对人脑基因调控影响

美国西奈山伊坎医学院Towfique Raj研究组利用整合全基因组测序和多组数据，揭示了结构变异（SV）对人脑基因调控的影响。相关论文3月14日发表于《自然—神经科学》。

他们报告了使用来自老年人和阿尔茨海默病患者的1760个短读长全基因组发现的 170996个SV。通过应用数量性状基因座（SV-xQTL）分析，他们量化了顺式作用SV对死后脑组织中组蛋白修饰、基因表达、剪接和蛋白质丰度的影响。超过3200个SV与至少一种分子表型相关。

他们发现65%~99%的SV-eQTL跨队列和大脑区域的可重复性。SV与mRNA和蛋白质的关联在超过87%的SV基因对中具有相同的作用方向。中介分析显示约8%的SV-eQTL由组蛋白乙酰化介导，约11%由剪接介导。此外，SV与进行性核上性麻痹的关联确定了以前已知的和新的SV。