高时间分辨率谱系追踪FMC

Wed Mar 09 14:28:34 CST 2022

美国南加州大学Darryl Shibata、莫菲特癌症中心Alexander R. A. Anderson和英国伦敦玛丽女王大学Trevor A. Graham研究团队合作取得最新进展。他们在人体组织中以高时间分辨率进行细胞谱系追踪波动甲基化时钟 (FMC)。相关研究近日发表于《自然—生物技术》。

目前,记录细胞祖先的分子钟突变太慢,无法测量成体组织中细胞更新的短时间尺度动态。

在该研究中,研究人员证明波动的DNA甲基化标记可以用作细胞中的时钟,其中正在进行的甲基化和去甲基化导致甲基化和非甲基化状态之间反复切换。他们使用标准甲基化阵列识别内源性波动 CpG 位点,并开发数学模型以从这些数据中定量测量成人干细胞动力学。推测小肠隐窝含有比结肠略多的干细胞,小肠中的干细胞置换速度较慢。种系APC突变增加了每个隐窝的替换数量。

研究人员通过测量发现血液中急性白血病的快速扩张和慢性病的缓慢增长。 因此,人类体细胞生成和死亡的模式可以通过FMC进行测量。

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