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结核病人中差不多20%—30%的病人有糖尿病，所以结核病大夫不能只会治疗结核病，还要会治疗糖尿病。艾滋病病人免疫功能低下，常常合并结核病，这种治疗就更复杂。抗结核治疗要求4种药或5种药的联合，这对肝脏功能有损坏，所以怎么实现有效抗结核治疗又可保护肝脏很重要。
如果病人肾功能不好，有些抗结核药物就不能用。此外，还有老年结核病，老年人可能还有高血压、糖尿病、肾炎、脑血管等问题，多种病症同时出现在一个人身上，病人吃的各种药物可能相互影响，治疗过程中也有很多需要考虑的事项。所以，结核大夫虽是专科大夫，但一定要有全科医生的基本知识。
开展结核分枝杆菌、血清学、耐药相关基因等免疫学诊断等研究，直接或间接为结核病的临床诊断治疗提供了很多信息和支持。比如结核病的诊断，病人开始咳嗽、咳痰，X光片以及CT发现肺上有病变，如果病人的痰里也找到结核菌，这种病人的诊断就比较容易。但是在所有肺结核病人中，有40%—60%的病人痰里找不到结核菌，仅根据临床症状、X光片或CT上面的表现来诊断结核，不光诊断有困难，有时还可能造成误诊、漏诊，这就需要在实验室里开展分子生物学检查，通过找到结核菌里的DNA用于诊断。
同样，结核病患者对药物是不是耐药了，过去靠细菌学方法需要很长时间，而实验室对结核菌分子生物学耐药突变基因的检测，可支持临床为病人提供更有效治疗方案。实验室的血清学、免疫学诊断，目前已成为辅助结核病诊断的常规诊断方法。