转录因子蛋白质相互作用组揭示心脏病遗传决定因素

美国格莱斯顿研究所Deepak Srivastava、Katherine S. Pollard等研究人员合作利用转录因子蛋白质相互作用组揭示心脏病的遗传决定因素。相关论文近日在线发表于《细胞》。

研究人员假设，先天性心脏病（CHD）的遗传决定因素可能在于转录因子的蛋白质相互作用组，这些转录因子的突变会导致CHD。研究人员在人类心脏祖细胞中定义了两个转录因子（GATA4和TBX5）的相互作用组，并将结果与近9000个来自亲属三人组的外显子进行整合，发现与CHD相关的新发错义变体在相互作用组中富集。根据残基、基因和渊源特征对交互组成员的变体进行评分，研究人员确定了可能的CHD致病基因，包括表观遗传阅读器GLYR1。

GLYR1和GATA4广泛地共同占据并共同激活心脏发育基因，所确定的GLYR1错义变体破坏了与GATA4的相互作用，损害了小鼠的体外和体内功能。这种综合的蛋白质组学和遗传学方法提供了一个框架，可用于确定心脏疾病中遗传变异体的优先次序并进行研究。