空间蛋白质基因组学揭示肝巨噬细胞微环境

近日，比利时根特大学Charlotte L. Scott、Martin Guilliams等研究人员合作揭示不同的和进化上保守的肝巨噬细胞微环境。相关论文1月11日在线发表于《细胞》杂志。

研究人员报道了健康和肥胖的人类以及小鼠肝脏的空间蛋白质组图谱，并结合了单细胞CITE-seq、单核测序、空间转录组学和空间蛋白质组学。通过整合这些多组学数据集，研究人员提供了经过验证的策略来可靠地区分和定位所有肝细胞，包括胆管中的脂质相关巨噬细胞（LAM）群。然后，研究人员将这个图谱在七个物种中比对，从而揭示出真正的库普弗细胞和LAM的保守程序。

研究人员还揭示了这些巨噬细胞各自的空间分辨细胞微环境和驱动其独特转录组特性的微环境回路。研究人员证明LAM是由局部脂质暴露诱导的，导致它们在小鼠和人类肝脏的脂肪变性区域中被诱导，而库普弗细胞的发育关键取决于它们通过进化上保守的ALK1-BMP9/10轴与肝星状细胞的相互作用。

据了解，肝脏是人体最大的实体器官，但对其特征仍然不完全了解。