科学家完成单个HIV-1前病毒转录、整合和序列的平行分析

美国MGH拉贡研究所Mathias Lichterfeld小组完成单个HIV-1前病毒转录、整合和序列的平行分析。相关论文1月12日在线发表于《细胞》杂志。

研究人员应用一种方法来分析了单个前病毒的转录活性和染色体位置，描述了转录活跃和沉默的前病毒种类的全局基因组和表观遗传图谱，并评估了接受抑制性抗逆转录病毒疗法患者的纵向演化。利用全基因组的表观遗传学参考数据，结果表明，前病毒的转录活性与整合位点线性附近及其染色体间和染色体内接触区的激活表观遗传学特征有关。转录活跃的前病毒在长期的抗逆转录病毒疗法中被正向选择，然而，这种模式被大型的病毒感染细胞克隆所违反，这些细胞可能通过提高内在的增殖活性而超过了负向选择。这项结果表明，在宿主因素的选择压力下，转录活跃的前病毒正在动态地演化。

据悉，尽管有抗逆转录病毒疗法ART，但持续存在的HIV-1感染细胞经常被认为是“转录沉默的”，但活跃的病毒基因表达可能发生在一些细胞中，这对病毒潜伏期的概念是个挑战。