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结直肠癌的治疗应采取个体化治疗原则，根据患者的年龄、体质、肿瘤的病理类型、侵犯范围（分期），选用合适的治疗方法，以期最大幅度地根治肿瘤，提高治愈率。
结直肠癌侵犯范围不同，治疗原则也相应不同：原位癌可在内镜下治疗，效果较好，可达到根治的效果；早期大肠癌，外科手术治疗可以达到根治的目的，部分也可采用内镜治疗达到根治；中晚期大肠癌，多以手术为主的综合治疗，即术后辅助应用化疗及靶向治疗、放疗等方法；对于不能做手术的中晚期大肠癌患者，可采用根据病情选用放疗、化疗或靶向治疗，以改善患者生存。复发或者伴远处转移性大肠癌的患者，可以采取化疗或者靶向治疗，部分患者也可采用手术来延长患者的生存，尤其是结肠癌患者。复发或者转移的直肠癌，则以放化疗或靶向治疗为主，一般不做手术。
化疗治疗中常见的不良事件
原因：化疗药物通过刺激胃肠道粘膜引起胃肠功能紊乱症状。
表现：厌食、恶心、呕吐、腹胀、腹痛、腹泻、便秘等。
处理：心理、饮食调节，应用止吐、保护胃肠粘膜、止泻、通便等药物，腹泻严重、不能正常进食者需及时就医住院。出院后若腹泻进行性加重，应及时到当地医院给予静脉补液支持治疗，否则将导致脱水、电解质紊乱而危及患者生命。
原因：化疗药物抑制骨髓造血细胞生成。
表现：白（粒）细胞减少最常见，严重者红细胞、血小板均减少，临床常表现为易感冒、四肢酸软无力、疲乏等。
处理：使用升血细胞药物，最为快速有效的是人血细胞刺激集落生长因子。
原因：绝大部分化疗药物在肝内代谢，对肝细胞均有不同程度损害。
表现：肝功能异常（肝转氨酶升高），严重者出现黄疸、药物中毒性肝炎。
处理：化疗全程应用静脉或口服保肝药物，肝转氨酶超过正常值2倍以上者需暂停化疗。
原因：化疗药物对周围末梢神经的损害，多见于含铂类的化疗方案。
表现：肢端麻木、感觉迟钝等，严重者可发生喉痉挛、影响运动功能甚至瘫痪。
处理：口服或肌注B族维生素，化疗期间避免接触冷水、不喝冷饮料，III级以上神经损害需暂停化疗及减少药物剂量。
原因：口服希罗达产生的特有症状。
表现：手足麻木刺痛、红斑和肿胀、潮湿脱屑、皮肤溃疡。
处理：局部涂抹护肤霜，口服维生素B6,大多数症状轻微，少数严重者（III级）需暂停化疗及减少药物剂量。