蛋白质系统的多尺度图谱阐明癌症突变

美国加州大学Trey Ideker、Nevan J. Krogan等研究人员合作利用蛋白质系统的多尺度图谱阐明癌症突变。该研究于2021年10月1日发表于国际一流学术期刊《科学》。

研究人员创建了一个全面的癌症蛋白系统图谱，在多个分析尺度上整合了新的和已发表的多组学相互作用数据。然后，研究人员开发了一个统一的统计模型，指出了13种癌症类型中395个处于突变选择下的特定系统。这个图谱被称为NeST（肿瘤中的嵌套系统），包含了典型的过程和显著的发现，包括抑制磷脂酰肌醇3-激酶信号传导的PIK3CA-actomyosin复合物和促进肿瘤增殖的胶原复合物的反复突变。这些系统可作为临床生物标志物，并牵涉到总共548个基因在癌症进化和发展中的作用。这项工作显示了不同的肿瘤突变是如何在不同规模的蛋白质集合体上汇聚的。

据介绍，癌症研究的一个主要目标是了解分布在不同基因上的突变如何影响共同的细胞系统，包括多蛋白复合体和集合体。两个挑战——如何全面绘制此类系统，以及如何确定哪些系统处于突变选择之下，已经阻碍了这种理解。